Przedmiotem zainteresowań Polskiego Towarzystwa Medycyny Sportowej jest poznanie naukowych podstaw procesów fizjologicznych i patologicznych, jakie dokonują się w organizmie człowieka pod wpływem wysiłku fizycznego lub jego braku; ochrona zdrowia osób biorących udział w sporcie, zajęciach rekreacyjnych i wychowaniu fizycznym; profilaktyka chorób przewlekłych; leczenie chorób będących następstwem aktywności fizycznej.